Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp13a2Q9CTG6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a2Q9CTG6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a2Q9CTG6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms