Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR99

4930544G11Rik, RIKEN cDNA 4930544G11, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544G11RikQ9CR99 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930544G11RikQ9CR99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544G11RikQ9CR99 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms