Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcc1Q99LI2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcc1Q99LI2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcc1Q99LI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcc1Q99LI2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms