Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lactb2Q99KR3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lactb2Q99KR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lactb2Q99KR3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms