Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrabdQ99JY4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TrabdQ99JY4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrabdQ99JY4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrabdQ99JY4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrabdQ99JY4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms