Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcd2Q99JR8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcd2Q99JR8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd2Q99JR8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd2Q99JR8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms