Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dhx58Q99J87 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dhx58Q99J87 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx58Q99J87 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx58Q99J87 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms