Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klhdc4Q921I2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Klhdc4Q921I2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Klhdc4Q921I2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Klhdc4Q921I2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klhdc4Q921I2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Klhdc4Q921I2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Klhdc4Q921I2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Klhdc4Q921I2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Klhdc4Q921I2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms