Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsqQ91ZF4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtsqQ91ZF4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsqQ91ZF4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsqQ91ZF4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtsqQ91ZF4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.8 ms