Protein–RNA interactions for Protein: Q91XA5

Snapc2, snRNA-activating protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc2Q91XA5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snapc2Q91XA5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snapc2Q91XA5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snapc2Q91XA5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snapc2Q91XA5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms