Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep1Q91W92 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep1Q91W92 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdc42ep1Q91W92 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep1Q91W92 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep1Q91W92 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms