Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itm2cQ91VK4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itm2cQ91VK4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itm2cQ91VK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms