Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TraipQ8VIG6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TraipQ8VIG6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TraipQ8VIG6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TraipQ8VIG6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TraipQ8VIG6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TraipQ8VIG6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TraipQ8VIG6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TraipQ8VIG6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TraipQ8VIG6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TraipQ8VIG6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TraipQ8VIG6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 398.6 ms