Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc28Q8VCE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc28Q8VCE1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms