Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3R3

Plcd4, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcd4Q8K3R3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Plcd4Q8K3R3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plcd4Q8K3R3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Plcd4Q8K3R3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plcd4Q8K3R3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms