Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc12Q8K2L8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trappc12Q8K2L8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trappc12Q8K2L8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc12Q8K2L8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc12Q8K2L8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms