Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd3Q8K2F0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brd3Q8K2F0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms