Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hacd3Q8K2C9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hacd3Q8K2C9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hacd3Q8K2C9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms