Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d5Q8JZW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d5Q8JZW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d5Q8JZW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms