Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2-Q4Q8HWB2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2-Q4Q8HWB2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H2-Q4Q8HWB2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-Q4Q8HWB2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
H2-Q4Q8HWB2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.1 ms