Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Setd1bQ8CFT2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Setd1bQ8CFT2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Setd1bQ8CFT2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Setd1bQ8CFT2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Setd1bQ8CFT2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Setd1bQ8CFT2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms