Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc73Q8CDM4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc73Q8CDM4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms