Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Chic1Q8CBW7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Chic1Q8CBW7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Chic1Q8CBW7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Chic1Q8CBW7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Chic1Q8CBW7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Chic1Q8CBW7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Chic1Q8CBW7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms