Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo48Q8CAT8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo48Q8CAT8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo48Q8CAT8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo48Q8CAT8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms