Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp20Q8C6M1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp20Q8C6M1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp20Q8C6M1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp20Q8C6M1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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