Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx16Q8C080 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Snx16Q8C080 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Snx16Q8C080 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx16Q8C080 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms