Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Strip1Q8C079 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Strip1Q8C079 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Strip1Q8C079 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strip1Q8C079 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms