Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ift57Q8BXG3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ift57Q8BXG3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ift57Q8BXG3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ift57Q8BXG3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ift57Q8BXG3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms