Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc3aQ8BX90 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3aQ8BX90 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3aQ8BX90 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc3aQ8BX90 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3aQ8BX90 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms