Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp398Q8BV16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp398Q8BV16 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp398Q8BV16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms