Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQY8

Hus1, Checkpoint protein HUS1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hus1Q8BQY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hus1Q8BQY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hus1Q8BQY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hus1Q8BQY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hus1Q8BQY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms