Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abraxas1Q8BPZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms