Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd55Q8BLD6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd55Q8BLD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms