Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Csgalnact1Q8BJQ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Csgalnact1Q8BJQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Csgalnact1Q8BJQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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Csgalnact1Q8BJQ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Csgalnact1Q8BJQ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csgalnact1Q8BJQ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Csgalnact1Q8BJQ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Csgalnact1Q8BJQ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Csgalnact1Q8BJQ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Csgalnact1Q8BJQ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csgalnact1Q8BJQ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Csgalnact1Q8BJQ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Csgalnact1Q8BJQ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csgalnact1Q8BJQ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csgalnact1Q8BJQ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csgalnact1Q8BJQ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Csgalnact1Q8BJQ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csgalnact1Q8BJQ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Csgalnact1Q8BJQ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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