Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slfnl1Q8BHW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slfnl1Q8BHW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Slfnl1Q8BHW9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slfnl1Q8BHW9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slfnl1Q8BHW9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slfnl1Q8BHW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slfnl1Q8BHW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slfnl1Q8BHW9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slfnl1Q8BHW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Slfnl1Q8BHW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms