Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Slfnl1Q8BHW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Slfnl1Q8BHW9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Slfnl1Q8BHW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Slfnl1Q8BHW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms