Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1l4Q8BGJ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2af1l4Q8BGJ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2af1l4Q8BGJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms