Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc38a9Q8BGD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc38a9Q8BGD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc38a9Q8BGD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc38a9Q8BGD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms