Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrtm2Q8BGA3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrtm2Q8BGA3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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