Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pknox2Q8BG99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pknox2Q8BG99 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pknox2Q8BG99 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms