Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Katnb1Q8BG40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Katnb1Q8BG40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Katnb1Q8BG40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Katnb1Q8BG40 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms