Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg2bQ80XK6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg2bQ80XK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg2bQ80XK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms