Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcsk9Q80W65 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcsk9Q80W65 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcsk9Q80W65 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.4 ms