Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CyldQ80TQ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CyldQ80TQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CyldQ80TQ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CyldQ80TQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms