Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf516Q7TSH3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf516Q7TSH3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf516Q7TSH3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf516Q7TSH3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms