Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NexnQ7TPW1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NexnQ7TPW1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NexnQ7TPW1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NexnQ7TPW1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NexnQ7TPW1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NexnQ7TPW1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NexnQ7TPW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NexnQ7TPW1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms