Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Prrc2bQ7TPM1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Prrc2bQ7TPM1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prrc2bQ7TPM1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Prrc2bQ7TPM1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms