Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc39a4Q78IQ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc39a4Q78IQ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc39a4Q78IQ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc39a4Q78IQ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a4Q78IQ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc39a4Q78IQ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc39a4Q78IQ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc39a4Q78IQ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc39a4Q78IQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms