Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpopQ6ZWS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SpopQ6ZWS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpopQ6ZWS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpopQ6ZWS8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpopQ6ZWS8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms