Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b4Q6Q477 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b4Q6Q477 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b4Q6Q477 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp2b4Q6Q477 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms