Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd5Q6P5H6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Frmd5Q6P5H6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd5Q6P5H6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms